ZoneTechHợp tác xã kê khai thuế GTGT như thế nào: kỳ khai và các bước
Hợp tác xã kê khai thuế GTGT theo ba bước: xác định phương pháp tính thuế, chọn kỳ khai tháng hoặc quý, rồi lập tờ khai nộp cho cơ quan thuế quản lý trực tiếp. HTX dùng chung mẫu tờ khai và hạn nộp với doanh nghiệp. Điểm giống và khác giữa hai loại hình có ở bài hợp tác xã có phải là doanh nghiệp không.
Mục lục
Văn bản áp dụng khi hợp tác xã kê khai thuế GTGT
Bộ văn bản để hợp tác xã kê khai thuế GTGT đã thay toàn bộ từ 1/7/2026. Theo quy định chuyển tiếp của Thông tư 89/2026/TT-BTC, tờ khai cho kỳ tính thuế trước ngày này vẫn dùng mẫu cũ.
| Văn bản | Thay cho | Nội dung HTX cần |
|---|---|---|
| Luật Quản lý thuế 108/2025/QH15 | Luật Quản lý thuế 2019 | Nguyên tắc khai, khai bổ sung |
| Nghị định 252/2026/NĐ-CP | Nghị định 126/2020/NĐ-CP | Thời hạn nộp hồ sơ khai thuế (Điều 10) |
| Thông tư 89/2026/TT-BTC | Thông tư 80/2021/TT-BTC | Mẫu tờ khai, kỳ khai tháng hay quý (Điều 19) |
Bước 1: Xác định phương pháp tính thuế
Luật Thuế GTGT cho HTX hai cách tính thuế. HTX có doanh thu năm từ 1 tỷ đồng áp dụng phương pháp khấu trừ. HTX dưới ngưỡng tính trực tiếp trên doanh thu, trừ khi đăng ký tự nguyện khấu trừ.
Phương pháp khấu trừ là cách lấy thuế đầu ra trừ thuế đầu vào có hóa đơn hợp lệ. Phương pháp trực tiếp là cách lấy doanh thu hàng chịu thuế nhân một tỷ lệ cố định. Thông tư 89/2026/TT-BTC gắn mỗi phương pháp với một mẫu tờ khai.
- Mẫu 01/GTGT: người nộp thuế theo phương pháp khấu trừ.
- Mẫu 04/GTGT: người nộp thuế tính trực tiếp trên doanh thu.
Phương pháp cũng quyết định loại hóa đơn HTX được lập. Phần này được giải thích ở bài hợp tác xã có xuất được hóa đơn VAT không.
Bước 2: Chọn kỳ khai tháng hay quý
Nguyên tắc chung khi hợp tác xã kê khai thuế GTGT là khai theo tháng. Kỳ khai thuế là khoảng thời gian mà số liệu được gom vào một tờ khai, tính theo tháng hoặc theo quý. Khoản 1 Điều 19 Thông tư 89/2026/TT-BTC cho khai thuế GTGT theo quý trong hai trường hợp sau (Thư Viện Pháp Luật).
- Tổng doanh thu bán hàng, cung cấp dịch vụ năm trước liền kề từ 50 tỷ đồng trở xuống.
- Hợp tác xã mới bắt đầu hoạt động, kinh doanh.
HTX đang khai tháng muốn chuyển sang quý thì gửi văn bản mẫu 01/ĐK-TĐKTT. Hạn gửi chậm nhất là 31/1 của năm bắt đầu khai quý. Kỳ khai đã chọn giữ ổn định cả năm dương lịch.
Nếu khai quý mà không đủ điều kiện, HTX phải khai tháng từ tháng đầu của quý tiếp theo. HTX nộp lại hồ sơ tháng cho các quý trước và tính tiền chậm nộp nếu có.
Bước 3: Nộp tờ khai đúng hạn
Hạn nộp nằm ở Điều 10 Nghị định 252/2026/NĐ-CP (VOV). Có hai mốc chính khi hợp tác xã kê khai thuế GTGT.
- Khai tháng: chậm nhất ngày 20 của tháng tiếp theo, ví dụ tờ khai tháng 7/2026 hạn 20/8/2026.
- Khai quý: chậm nhất ngày cuối cùng của tháng đầu quý tiếp theo, ví dụ tờ khai quý 3/2026 hạn 31/10/2026.
Hợp tác xã kê khai thuế GTGT với cơ quan thuế quản lý trực tiếp (khoản 2 Điều 19 Thông tư 89/2026/TT-BTC). Nghị định 245/2026/NĐ-CP gia hạn nộp tiền thuế GTGT cho đối tượng đủ điều kiện. Ví dụ, tiền thuế quý 3/2026 được nộp chậm nhất 30/12/2026. Nghị định này không gia hạn thời hạn nộp tờ khai.
Ví dụ: hợp tác xã kê khai thuế GTGT một quý
Ví dụ này là giả định, có cả hàng không chịu thuế. HTX trồng rau và bán thêm phân bón, tính thuế khấu trừ và khai theo quý.
| Khoản trong quý | Số tiền | Cách tính |
|---|---|---|
| Doanh thu rau tươi tự trồng | 200 triệu đồng | Không chịu thuế, không có thuế đầu ra |
| Doanh thu bán phân bón | 400 triệu đồng | Thuế suất 5%, thuế đầu ra 20 triệu đồng |
| Thuế đầu vào trên hóa đơn mua phân bón | 16 triệu đồng | Có hóa đơn GTGT hợp lệ |
| Thuế GTGT phải nộp | 4 triệu đồng | 20 triệu trừ 16 triệu |
Khi hợp tác xã kê khai thuế GTGT, doanh thu rau vẫn cần ghi sổ dù không phát sinh thuế. Kế toán đối chiếu chỉ tiêu tương ứng trên mẫu 01/GTGT mới. Kế toán nên tách sổ theo nhóm thuế ngay từ lúc lập hóa đơn.
Nếu cùng HTX đó tính trực tiếp, cách làm đơn giản hơn. Thuế bằng doanh thu hàng chịu thuế nhân tỷ lệ: 1% với phân phối hàng hóa, 3% với sản xuất. Với doanh thu bán phân bón 400 triệu đồng như bảng trên, thuế là 4 triệu đồng (tỷ lệ 1% cho phân phối hàng hóa).
Ba lỗi hay gặp khi hợp tác xã kê khai thuế GTGT như sau.
- Không tách sổ hàng tự sản xuất và hàng mua lại, cuối quý không biết khai nhóm nào.
- Tự chuyển sang khai quý mà không gửi văn bản 01/ĐK-TĐKTT đúng hạn.
- Nhầm hạn gia hạn nộp tiền thành hạn nộp tờ khai.
Cần người làm cùng? Xem giải pháp cho doanh nghiệp nông sản.
Câu hỏi thường gặp
Hợp tác xã kê khai thuế GTGT sai thì sửa thế nào?
HTX nộp hồ sơ khai bổ sung, vì Luật Quản lý thuế 2025 cho khai bổ sung trong 5 năm. Thời hạn tính từ ngày hết hạn nộp hồ sơ của kỳ có sai sót, kèm một số điều kiện.
Cuối năm HTX còn phải nộp gì ngoài tờ khai GTGT?
HTX nộp hồ sơ quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp, hạn chậm nhất ngày cuối tháng thứ 3 sau khi kết thúc năm. Báo cáo tài chính năm xem ở bài mẫu báo cáo tài chính hợp tác xã.
Hợp tác xã nông nghiệp có được miễn khai thuế GTGT không?
Không có quy định miễn khai riêng cho HTX. Hàng không chịu thuế chỉ làm giảm số thuế phải nộp, nghĩa vụ khai vẫn theo kỳ. Thông tin chung có ở chuyên mục hợp tác xã.
Muốn biết thêm về đội ngũ, bạn xem trang giới thiệu ZoneTech. Cần trao đổi thêm, bạn gọi hoặc nhắn Zalo 0976.179.886, hoặc gửi yêu cầu ở trang liên hệ.
Cập nhật lần cuối: 01/11/2026 · Biên soạn: Đỗ Hữu Thuận